Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM208BQ5VWN6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM208BQ5VWN6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms