Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRQ13535 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRQ13535 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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