Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-1Q07627 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms