Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNDQ07001 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms