Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FLI1Q01543 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms