Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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