Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC1P33527 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms