Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIL1P09327 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms