Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPLP1P05386 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPLP1P05386 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms