Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD8O14715 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms