Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CYSRT1A8MQ03 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms