Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCAF1Q9H7N4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms