Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd8Q9CX56 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms