Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CMSS1Q9BQ75 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMSS1Q9BQ75 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms