Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFT1Q96AA3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms