Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TRIM41Q8WV44 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TRIM41Q8WV44 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms