Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNED1Q8TER0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms