Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDZRN4Q6ZMN7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDZRN4Q6ZMN7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms