Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMOD2Q6P5Q4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms