Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-1Q15270 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-1Q15270 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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