Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPNMBQ14956 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPNMBQ14956 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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