Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATMQ13315 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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