Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PRDM2Q13029 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRDM2Q13029 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
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