Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFIAQ12857 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFIAQ12857 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms