Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms