Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms