Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRG2P13727 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRG2P13727 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRG2P13727 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRG2P13727 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRG2P13727 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG2P13727 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG2P13727 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG2P13727 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG2P13727 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRG2P13727 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms