Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP10AO60312 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms