Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf2O43822 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms