Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM6AO15550 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms