Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit3W8DXL4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrit3W8DXL4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrit3W8DXL4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrit3W8DXL4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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