Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm3550W4VSN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3550W4VSN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3550W4VSN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3550W4VSN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms