Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crlf3Q9Z2L7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Crlf3Q9Z2L7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Crlf3Q9Z2L7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Crlf3Q9Z2L7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms