Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc2Q9Z2H7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gipc2Q9Z2H7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gipc2Q9Z2H7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gipc2Q9Z2H7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gipc2Q9Z2H7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gipc2Q9Z2H7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gipc2Q9Z2H7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms