Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mbd3Q9Z2D8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Mbd3Q9Z2D8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,24
Mbd3Q9Z2D8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28,95■■■□□ 2,23
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Mbd3Q9Z2D8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Mbd3Q9Z2D8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms