Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D3

Gsdme, Gasdermin-E, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmeQ9Z2D3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GsdmeQ9Z2D3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GsdmeQ9Z2D3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GsdmeQ9Z2D3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GsdmeQ9Z2D3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GsdmeQ9Z2D3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms