Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syngr4Q9Z1L2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syngr4Q9Z1L2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syngr4Q9Z1L2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms