Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nek4Q9Z1J2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nek4Q9Z1J2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nek4Q9Z1J2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nek4Q9Z1J2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nek4Q9Z1J2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms