Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ror1Q9Z139 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ror1Q9Z139 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ror1Q9Z139 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ror1Q9Z139 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ror1Q9Z139 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms