Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NgfrQ9Z0W1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgfrQ9Z0W1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgfrQ9Z0W1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NgfrQ9Z0W1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms