Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn3Q9Z0G9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn3Q9Z0G9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn3Q9Z0G9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn3Q9Z0G9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms