Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AireQ9Z0E3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AireQ9Z0E3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AireQ9Z0E3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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