Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn5Q9WVD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn5Q9WVD4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clcn5Q9WVD4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn5Q9WVD4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms