Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx1Q9WV80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx1Q9WV80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx1Q9WV80 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx1Q9WV80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms