Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mixl1Q9WUI0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mixl1Q9WUI0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mixl1Q9WUI0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mixl1Q9WUI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mixl1Q9WUI0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mixl1Q9WUI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms