Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClcnkbQ9WUB6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ClcnkbQ9WUB6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClcnkbQ9WUB6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClcnkbQ9WUB6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms