Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NbnQ9R207 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NbnQ9R207 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NbnQ9R207 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NbnQ9R207 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms