Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bcl11aQ9QYE3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Bcl11aQ9QYE3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Bcl11aQ9QYE3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11aQ9QYE3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11aQ9QYE3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bcl11aQ9QYE3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms