Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opn4Q9QXZ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn4Q9QXZ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Opn4Q9QXZ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn4Q9QXZ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn4Q9QXZ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.4 ms