Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyhr1Q9QXA1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyhr1Q9QXA1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyhr1Q9QXA1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyhr1Q9QXA1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyhr1Q9QXA1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms